اولین گزارش از گونه Neoscytalidium novaehollandiae بر روی درختان بادام، زیتون گردو در ایران

کد مقاله : 1078-24IPPC (R2)
نویسندگان
1گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان
2کرمان- دانشگاه شهیدباهنر- دانشکده کشاورزی- بخش گیاه پزشکی
3مؤسسه کشاورزی مدیترانه، دانشگاه پلی تکنیک والنسیا، والنسیا، اسپانیا.
4گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.
چکیده
خانواده Botryosphaeriaceae شامل تعداد زیادی گونه‌های قارچی است که بیشتر آنها به عنوان عوامل بیماری‌زای مهم بر روی درختان مختلف مطرح می‌باشند. به منظور تعیین عوامل قارچی همراه با زوال درختان بادام، زیتون و گردو از باغ‌های این محصولات در استان‌های اصفهان، فارس، کرمان،‌ کهگیلویه و بویر احمد و قم طی سال‌های 1394-1397 بازدید گردید. از شاخه درختان بیمار با نشانه‌های سرخشکیدگی، شانکر و صمغ‌زدگی نمونه‌برداری گردید. پس از تهیه برش‌های عرضی از نمونه‌های جمع‌آوری شده نشانه‌های داخلی که به صورت تغییر رنگ بافت چوب بودند، ثبت گردید. عمل جداسازی از بافت‌های تغییر رنگ یافته بافت چوب انجام شد. شاخه‌های جمع‌آوری شده با اسپری کردن با الکل 96% و عبور دادن از روی شعله ضدعفونی شدند. قطعات ضدعفونی شده در مرحله بعد به صورت طولی برش داده شدند و از نواحی بین بافت سالم و تغییر رنگ یافته داخلی، قطعاتی کوچکی با اسکالپل جدا و مستقیماً روی محیط کشت عصاره سیب زمینی- آگار (Potato Dextrose Agar=PDA) حاوی سولفات تتراسیکلین قرار داده شدند. تشتک‌های پتری در تاریکی و در دمای 25 درجه سانتی‌گراد تا ظهور پرگنه‌های قارچی نگهداری شدند. تعداد 78 جدایه از جنس Neoscytalidium از درختان آلوده جداسازی گردید که از این تعداد 24 جدایه از درختان بادام (از استان‌های اصفهان، کرمان و کهگیلویه و بویراحمد)، 27 جدایه از درختان زیتون (از استان‌های اصفهان، قم و کهگیلویه و بویراحمد) و 27 جدایه نیز از درختان گردو (از استان‌های اصفهان، فارس و کرمان)بدست آمد. جدایه‌های بدست آمده ابتدا بر اساس ویژگی‌های ریخت شناسی و محیط کشت شناسایی شدند. شناسایی جدایه‌های انتخاب شده به روش مولکولی نیز مورد تأیید قرار گرفت. برای این کار کل DNA جدایه‌ها با استفاده از روش CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) استخراج گردید و شناسایی ریخت‌شناسی جدایه‌ها با تکثیر و تجزیه و تحلیل ناحیه ITS و بخشی از ژن فاکتور بسط دهنده نسخه‌برداری (Tef-1a) به ترتیب با استفاده از جفت آغازگرهای ITS1/ITS4 و EF1-688F/EF1-1251R مورد تأیید قرار گرفت. بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی و ملکولی این جدایه‌ها به عنوان گونه Neoscytalidium novaehollandiae تشخیص داده شدند. بررسی منابع موجود نشان می‌دهد که این مطالعه اولین گزارش از حضور این گونه بر روی درختان بادام، زیتون و گردو در دنیا می‌باشد.
کلیدواژه ها
 
Title
First report of Neoscytalidium novaehollandiae on almond, olive and walnut trees in Iran
Authors
Abstract
The family Botryosphaeriaceae contains many fungal species, which have been recognized as important pathogens on various crop trees. In order to determine the fungal agents associated with the decline of almond, olive and walnut trees, a survey was conducted in orchards of these crops in Isfahan, Kerman, Fars, Kohgiluyeh and Boyer Ahmad and Qom provinces during 2016-18. Wood samples were collected from affected branches of diseased trees showing dieback, canker and gumming symptoms. Transversal cuts were made from infected branches to record any internal wood discoloration. Fungal isolations were performed from discolored wood tissues. Branches were flame sterilized by spraying with 96% ethanol and passing through a flame. Disinfected segments were then cut longitudinally and small wood chips from the margin between healthy and necrotic wood tissues were aseptically removed with a scalpel and placed onto tetracycline-amended potato dextrose gar (PDA) directly. These plates were incubated in the dark at 25 °C until the emergence of fungal colonies. Seventy-eight isolates of Neoscytalidium were obtained from affected trees. Of these, 24 isolates were isolated from almond (from Isfahan, Kerman, Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad provinces), 27 isolates were also obtained from olive trees (from Isfahan, Qom, Kohgiluyeh and Boyer-Ahmad provinces) and 27 isolates were recovered from walnut (from Isfahan, Fars and Kerman provinces). These isolates were initially identified based on morphological and cultural characteristics. Morphological identifications of the selected isolates were confirmed by molecular methods. Total genomic DNA of the isolates was extracted with CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) method, and identification of the isolates was confirmed by sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) nrDNA region and a partial sequence of translation elongation factor 1-α gene (Tef-1a) using the primers pairs ITS1/ITS4 and EF1-688F/EF1-1251R, respectively. Based on morphological and molecular data all these isolates were identified as Neoscytalidium novaehollandiae. According to references review, this is the first report of the presence of this species on almond trees in Iran, and olive and walnut trees in the world.
Keywords
Canker, dieback, Botryosphaeriaceae, ITS, Tef