معرفی چهار آرایه جدید از گونه مرکب Fusarium solani جدا شده از کدوئیان در ایران

کد مقاله : 1079-24IPPC (R3)

¹دانشگاه شیراز-دانشکده کشاورزی-بخش گیاهپزشکی

²گروه گیاهپزشکی بخش گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز شیراز

گیاهان تیره کدوئیان، از محصولات مهم کشاورزی در ایران به شمار می‌روند. گونه مرکب Fusarium solani (FSSC) به عنوان یکی از مهم‌ترین بیمارگرهای خانواده کدوئیان در ایران گزارش شده است. بر اساس مطالعات انجام شده، FSSC حداقل د ارای 60 گونه مجزای فیلوژنتیکی می‌باشد. به‌دلیل تنوع بالای ریخت‌شناختی در بین جدایه‌های جداسازی شده از کدوئیان که در کلکسیون قارچ‌شناسی دانشگاه شیراز موجودند، شناسایی مجدد این جدایه‌ها بر اساس خصوصیات ریخت‌شناختی و مولکولی در این پژوهش انجام گردید. برای شناسایی آرایه‌های درون این گونه مرکب، نمایندگانی از بین جدایه‌ها (25 جدایه) که از لحاظ شکل پرگنه روی محیط کشت PDA، میزبان و محل جمع‌آوری با هم متفاوت بودند، جهت شناسایی انتخاب شدند. برای ارزیابی ویژگی‌های ریخت‌شناختی جدایه‌ها نظیر رنگ و میزان رشد پرگنه، از محیط‌کشت‌ سیب‌زمینی- دکستروز-آگار (PDA)، جهت تحریک جدایه‌ها به تولید ماکروکنیدیوم از محیط کشت-های برگ میخک- آگار (CLA) و اس. ان. ا (SNA) وجهت تحریک جدایه‌ها به تولید میکروکنیدیوم از محیط کشت پتاسیم-کلراید (KCL) استفاده شد. شناسایی و توصیف گونه‌ها با استفاده از مقالات Nalim et al. (2011)، Chehri et al .(2015) و Short et al. (2013) انجام شد. به‌منظور تائید شناسایی مرفولوژیکی، پس از استخراج دی‌ان‌ای با روش توصیف شده توسط Amer et al. (2011)، ناحیه ژنومی ITS-rDNA و ژن TEF1-α تمامی جدایه‌ها به‌ترتیب با آغازگرهای ITS1/ITS4 و EF-1H/EF-2T تکثبر و توالی‌یابی شدند. رسم درخت فیلوژنی با استفاده از روش maximum likelihood و نرم‌افزار MEGA 6.06 انجام شد. بر اساس نتایج مطالعات ریخت‌شناختی و آنالیزهای فیلوژنتیکی، چهار گونه‌ Fusarium keratoplasticum، F. falciforme، F. ensiforme clade و FSSC5 شناسایی شدند. تمامی گونه‌های شناسایی شده در این پژوهش، برای اولین بار به‌عنوان بیمارگر کدوئیان از ایران گزارش می‌شوند.

شناسایی؛ مرفولوژی؛ آنالیزهای فیلوژنتیکی؛ توالی‌یابی