شناسایی ویروس مولتان پیچیدگی برگ پنبه، گونه جدید بگوموویروس در ایران

کد مقاله : 1118-24IPPC (R3)
نویسندگان
1گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران
2گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز
3گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
چکیده
ختمی چینی (Hibiscus rosa-sinensis L.) درختچه ای زینتی در مناطق گرم و مرطوب کشور از جمله استان خوزستان است. در طی سال 98، در برخی از گیاهان ختمی چینی در شهر اهواز علایمی همچون علایم آلودگی بگوموویروس ها از قبیل توته ای شدن رگبرگ ها و فنجانی شدن برگ ها مشاهده شد. گیاهان جدید به دست آمده از قلمه زنی گیاهان دارای علایم نیز، در مراحل اولیه رشد خود علایم مشابهی را به نمایش گذاشتند. نمونه برگ ها جمع آوری شد و دی ان ا کل استخراج شده از این بافت ها به عنوان الگو در واکنش زنجیره ای پلی مراز (پی سی آر) مورد استفاده قرار گرفت. جفت آغازگرهای دژنرهBC/PCRV181 ، PCRC1/PBL1V2040 و β01/β02 به ترتیب برای ردیابی قطعات ژنومی DNA-A و DNA-B از ژنوم بگوموویروس ها و ژنوم کامل بتاستلایت های مرتبط با آنها مورد استفاده قرار گرفت. پی سی آر با استفاده از آغازگرهای نامبرده منجر به تکثیر یک قطعه تقریباً 500 جفت بازی از DNA-A، شامل توالی کامل چارچوب خوانش باز V2 و بخشی از توالی چارچوب خوانش باز V1 شد، در حالی که توالی DNA-B و همچنین ژنوم بتاستلایت ردیابی نشدند. قطعات تکثیریافته در پی سی آر خالص و در هر دو جهت ویریون و مکمل توالی یابی شدند. نتایج هم ترازی توالی های به دست آمده با رس شمارهای موجود در بانک ژن با استفاده از برنامه BlastX نشان داد که این توالی ها از تشابه 93 تا 96 درصدی با جدایه های گونه Cotton leaf curl Multan virus (CLCuMuV) برخوردارند. با توجه به حفاظت شدگی بالای قطعه تکثیریافته در بین اعضای جنس بگومویروس، بررسی های تبارزایی مشخص کرد که جدایه های ویروس پیچیدگی برگ پنبه به دست آمده از ختمی چینی از جمله جدایه خوزستان، یک شاخه تکاملی مجزا را تشکیل می دهند. این اولین گزارش از وقوع CLCuMuV در ایران است. با توجه به انتقال بگوموویروس ها توسط سفیدبالک Bemisia tabaci و حضور و فعالیت گسترده این ناقل در ایران، وقوع CLCuMuV می تواند تهدیدی جدی برای ایجاد خسارت در سایر محصولات زراعی مهم اقتصادی کشور باشد.
کلیدواژه ها
 
Title
Identification of Cotton leaf curl Multan virus, a new threating Begomovirus in Iran
Authors
nadia mosharaf ghahfarokhi, saeid tabein, mehdi mehrabi koushki
Abstract
The Chinese hibiscus, Hibiscus rosa-sinensis L., is a common ornamental shrub in warm and humid regions of Iran like Khuzestan province, southwestern Iran. During 2019, several Chinese hibiscus plants showing begomovirus like symptoms including vein enation and leaf cupping were observed in Ahvaz, Khuzestan province. New plants obtained from cuttings of symptomatic plants showed the same symptoms. Leaf samples of parental and progeny plants were collected and total DNA was extracted by the CTAB method. Polymerase chain reaction (PCR) was employed to test the begomovirus infection of the samples using degenerate primer pairs BC/PCRV181, PCRC 1/PBL1V 2040 and β01/β02 for detection of a part of genomic components (DNA-A and DNA-B) and the associated betasatellites of begomoviruses, respectively. An expected 500 bp fragment corresponding to complete V2 and partial V1 ORFs of monopartite begomovirus genome was amplified from symptomatic H. rosa-sinensis plants while no amplicon was detected for DNA-B or betasatellite DNA. PCR products were sequenced in both directions. Multiple sequence alignment of Khuzestan and other known GenBank isolates was performed using the BLASTx program implemented in the NCBI server. Results indicated that the Iranian isolate shares 93 to 96% pairwise identities with different GenBank isolates of Cotton leaf curl Multan virus (CLCuMuV). Phylogenetic analysis revealed that cotton leaf curl viruses originated from H. rosa-sinensis like Khuzestan isolate of CLCuMuV formed a separated cluster. To our knowledge, this is the first report of the CLCuMuV incidence in Iran. Considering the widespread presence of the whitefly vector in the country, this virus can be potentially a serious threat to other economically important crops in Iran.
Keywords
Chinese hibiscus, Cotton leaf curl virus, Begomovirus