گزارش جدیدی از گونه‌های جنس Alternaria متعلق به بخش Nimbya در ایران

کد مقاله : 1142-24IPPC (R3)
نویسندگان
1مرکز آموزش عالی شهید باکری میاندوآب، دانشگاه ارومیه
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
3گروه گیاهپزشکی/ دانشکده کشاورزی/ دانشگاه ارومیه
4مرکز آموزش عالی شهید باکری میاندوآب
چکیده
در راستای شناسایی گونه‌های متعلق به بخش Nimbya از جنس Alternaria، نمونه‌های آلوده‌ی برگ از گیاهان خانواده‌های Cyperaceae و Juncaceae طی سال‌های 1398-1396 از مناطق مختلف استان آذربایجان‌غربی جمع‌آوری گردید. نمونه‌ها ابتدا با آب مقطر سترون شسته شدند، سپس با محلول هیپوکلریت سدیم 5/0 درصد به مدت یک دقیقه ضد عفونی سطحی گردیدند و مجدداً سه بار با آب مقطر سترون آبکشی شدند. پس از رطوبت‌گیری نمونه‌ها، قطعات کوچکی (به طول تقریبی یک سانتی‌متر) از حدفاصل قسمت‌های آلوده و سالم بریده شدند و به تشتک‌های پتری حاوی محیط‌های کشت سیب زمینی-دکستروز-آگار (PDA)، آب-آگار دو درصد (WA 2%) و APDA (محیط غذایی PDA حاوی 5/2 میلی‌لیتر در لیتر اسید لاکتیک 25 درصد) منتقل گردیدند. تشتک‌های پتری در انکوباتور با دمای 223 درجه سلسیوس نگهداری شدند. همچنین، از روش کاغذ صافی مرطوب نیز برای جداسازی قارچ‌ها استفاده شد و قارچ‌های رشد کرده در سطح نمونه‌های گیاهی، مستقیماً با سوزن ظریف سترون برداشته و به تشتک‌های حاوی محیط کشت PDA منتقل شدند. جدایه‌های به دست آمده به روش تک هاگ خالص‌سازی شدند. شناسایی ریخت‌شناختی جدایه‌های خالص‌شده با کشت آنها روی محیط کشت سیب زمینی-هویج-آگار (PCA) و نگهداری در شرایط استاندارد (16 ساعت تاریکی و هشت ساعت روشنایی تحت نور سفید فلورسنت، دمای 223 درجه سلسیوس) انجام گرفت. تعداد 30 جدایه با ویژگی‌های معمول بخش Nimbya از جنس Alternaria و از گونه‌های مختلف گیاهان خانواده‌های Cyperaceae و Juncaceae جداسازی گردید. جهت تایید شناسایی اولیه جدایه‌ها، ناحیه ITS-rDNA و بخشی از ژن‌های gapdh، rpb2، tef-1a و alt a 1 جدایه‌ها به ترتیب با آغازگرهای ITS1/ITS4، gpd1/gpd2، RPB2–5F2/RPB2–7cR، EF1-728F/EF1-986R و Alt-for/Alt-rev تکثیر و توالی‌یابی شد. بر اساس ترکیب داده‌های ریخت‌شناختی و واکاوی تبارشناختی مبتنی بر پنج ژن، پنج گونه شامل Alternaria caricicola، A. scirpivora، Alternaria sp. 1، Alternaria sp. 2 و Alternaria sp. 3 شناسایی گردید. گونه A. scripivora برای بیوتای قارچی ایران جدید می‌باشد و سه گونه‌ی Alternaria sp. 1، Alternaria sp. 2 و Alternaria sp. 3 آرایه‌های جدید برای بیوتای قارچی دنیا می‌باشند.
کلیدواژه ها