گونه‏ های جدید ازColletotrichum از روی گیاهان وحشی تیره گرامینه و اویارسلام در برخی از استان‏ های شمالی ایران
کد مقاله : 1501-24IPPC (R2)
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی،دانشگاه شهید مدنی آذربایجان،تبریز،ایران
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران.
3مجتمع آموزش عالی شهید باکری میاندوآب، دانشگاه ارومیه.
4بخش بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران.
چکیده
به منظور جداسازی و شناسایی گونههای Colletotrichum از روی انواع گیاهان وحشی تیره گرامینه و اویارسلام در برخی مناطق در استانهای واقع در نوار شمالی کشور، نمونهبرداری از انواع گیاهان مذکور که علایم آنتراکنوز و لکه برگی در بافت های گیاهی نشان می دادند، صورت پذیرفت. این نمونهبرداری در طی فصول بهار، تابستان و پاییز سال های 1398-1397 در مناطق مختلف استان های گلستان، مازندران، گیلان و آذربایجان شرقی انجام گرفت. در مجموع تعداد 72 جدایه قارچی خالص شده Colletotrichum شامل 19 جدایه قارچی دارای کنیدیومهای مستقیم (غیر خمیده) و 53 جدایه قارچی با کنیدیومهای خمیده به دست آمد. جدایه های قارچی، تنوع زیادی را به لحاظ صفات ریخت شناختی و خصوصیات پرگنه نشان دادند. گروه بندی جدایه ها بر اساس صفات ریخت شناختی و مقایسه الگوی انگشت نگاری DNA با استفاده از نشانگر مولکولی BOX انجام گرفت. شناسایی جدایه ها براساس تلفیق صفات ریخت شناختی و مطالعات تبارزایی مبتنی بر توالی نوکلئوتیدی چند ناحیه ژنومی شامل Sod2،Apn2 ، MAT1/APN2، TUB2 و ITS-rDNA انجام شد. تعداد سه آرایه شناخته شده شامل C. nicholsoni از روی پاسپالوم (Paspalum diliatum)، C. sublineola از روی قیاق (Sorghum halepense) و نیشکر وحشی آسیایی (Saccharum spontaneum)، C. cereale از روی چچم (Lolium sp.) و نیشکر وحشی آسیایی (Saccharum spontaneum) و سه گونه شناخته نشده شامل Colletotrichum sp. 1 از روی نخل مرداب (Cyperus alternifolius)، Colletotrichum sp. 2 از روی سوروف (Echinochloa colonum)، Colletotrichum sp. 3 از روی میزبان ناشناس (Poaceae sp.) جداسازی شدند. بر اساس اطلاعات موجود این مطالعه اولین گزارش از جداسازی Colletotrichum از روی گیاهان سوروف و نخل مرداب در ایران محسوب میشود. Colletotrichum sp. 1، Colletotrichum sp. 2 و Colletotrichum sp. 3 به عنوان کاندیداهای گونه جدید برای بیوتای قارچی دنیا محسوب میشوند. مطالعات جامع ریخت-شناختی و تجزیه و تحلیل تبارزایی چندژنی به منظور توصیف آرایههای مذکور در حال انجام است.
کلیدواژه ها
Title
New species of Colletotrichum from wild Poaceae and Cyperaceae plants in some northern provinces of Iran
Authors
Abstract
In order to isolate and identify Colletotrichum species from a variety of wild Poaceae and Cyperacea plants in some areas in the northern provinces of the country, sampling were conducted from the mentioned plants showing anthracnose and leaf spot symptoms in their tissues. The sampling was done during the spring, summer and autumn seasons of 2018-2019 in different regions of Golestan, Mazandaran, Guilan and East Azarbaijan provinces. A total of 72 pure fungal isolates of Colletotrichum were obtained, including 19 isolates with straight conidia and 53 isolates with falcate/curved conidia. Fungal isolates showed great diversity in terms of morphological criteria and colony characteristics. Grouping of isolates was based on morphological criteria and comparison of DNA fingerprinting pattern using BOX molecular marker. Identification of isolates was performed based on a combination of morphology and nucleotide sequences of several genomic regions including Sod2, Apn2, MAT1/APN2, TUB2 and ITS-rDNA. Three known species, including C. nicholsoni from dallisgrass (Paspalum diliatum), C. sublineola from Johnson grass (Sorghum halepense) and wild sugarcane (Saccharum spontaneum), C. cereale from ryegrass (Lolium sp.) and wild sugarcane (Saccharum spontaneum), and three unknown species, include Colletotrichum sp. 1 from umbrella papyrus (Cyperus alternifolius), Colletotrichum sp. 2 from barnyard grass (Echinochloa sp.), Colletotrichum sp. 3 from the unknown host (Poaceae sp.) were identified. To our knowledge, this study is the first report of isolation of Colletotrichum from barnyard grass and marsh palm plants in Iran. Colletotrichum sp. 1, Colletotrichum sp. 2 and Colletotrichum sp. 3 are considered as new species candidates to the world's mycobiota. Comprehensive morphological studies and multigene phylogenetic analysis are underway to describe the species.
Keywords
anthracnose, DNA fingerprinting, morphology, sequencing