گزارش جدیدی از گونه‌های Colletotrichum از روی گیاهان زینتی در برخی از استان‌های ایران

کد مقاله : 1534-24IPPC (R2)
نویسندگان
1گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی،دانشگاه شهید مدنی آذربایجان،تبریز،ایران
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران
3گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران.
4مجتمع آموزش عالی شهید باکری میاندوآب، دانشگاه ارومیه.
چکیده
این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی گونه ‏های Colletotrichum از روی تعدادی از گیاهان زینتی در برخی از استان‏ های شمالی ایران انجام گرفت. در طی فصول بهار، تابستان و پاییز سال‏ های 1398-1397 نمونه‌برداری از تعداد زیادی از گیاهان زینتی و آپارتمانی که علایم آنتراکنوز، پوسیدگی و لکه برگی در بافت‏ های گیاهی نشان می‏ دادند، در برخی استان‏ های واقع در نوار شمالی ایران شامل گلستان، مازندران، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی صورت پذیرفت. در مجموع 247 نمونه گیاهی مشکوک به آلودگی به جنس Colletotrichum جمع آوری و کشت شد. تعداد 177 جدایه قارچی خالص شده Colletotrichum به ‌دست آمد. از این تعداد، 125جدایه قارچی دارای کنیدیوم‌های مستقیم (غیر خمیده) از 32 گونه گیاهی مختلف و 52 جدایه قارچی با کنیدیوم‌های غیرمستقیم (خمیده) از 11 گونه گیاهی مختلف به دست آمد. جدایه‏ های قارچی، تنوع زیادی را به لحاظ صفات ریخت‏ شناختی و خصوصیات پرگنه نشان دادند. گروه‌بندی جدایه‏ ها براساس صفات ریخت‏ شناختی و مقایسه الگوی انگشت نگاری DNA با استفاده از نشانگر مولکولی BOX انجام گرفت. شناسایی جدایه‏ ها بر اساس تلفیق صفات ریخت‏ شناختی و مطالعات تبارزایی مبتنی بر توالی نوکلئوتیدی ناحیه ژنی TUB2 انجام شد. نتایج نشان داد که جدایه‌ها به دو گونه شناخته شده C. truncatum و C. trichellum و دو گونه ناشناس شامل Colletotrichum sp. 1 به دست آمده از گیاه جعفری وحشی (Anthryscus sylvestris) و Colletotrichum sp. 2 به دست آمده از دیفن باخیا (Diffenbachia amoena) تعلق دارند. این مطالعه اولین گزارش از جداسازی C. truncatum از روی آگلونما (Aglaonema silver queen)، آدنیوم (Adenium obesum)، فیکوس بنجامین (Ficus benjamina)، سینگونیوم (Syngonium podophyllum) و گونه C. trichellum از روی گل کاغذی (Bougainvillea glabra) برای دنیا می‏ باشد. بر اساس اطلاعات گیاه جعفری وحشی به عنوان میزبان جدیدی برای جنس Colletotrichum محسوب می‌شود. آرایه‌ Colletotrichum sp. 2 نیز به عنوان کاندیدای گونه جدید برای بیوتای قارچی دنیا محسوب می‌شود. مطالعات جامع ریخت‌شناختی و تجزیه و تحلیل تبارزایی چندژنی به منظور توصیف آرایه مذکور در حال انجام است.
کلیدواژه ها
 
Title
New record of Colletotrichum species from ornamental plants in some provinces of Iran
Authors
Abstract
The aim of this study was to isolate and identify Colletotrichum species from a number of ornamental plants in some northern provinces of Iran. During the spring, summer and autumn seasons of 2018-2019, samplings were conducted from a large number of ornamental and decorative plants that showed symptoms of anthracnose, decay and leaf spot in Golestan, Mazandaran, East Azarbaijan and West Azarbaijan provinces of Iran. A total of 247 plant samples supposed of being infected with Colletotrichum were collected and cultured. A total of 177 pure fungal isolates of Colletotrichum were obtained. Of these, 125 fungal isolates with straight conidia from 32 different plant species and 52 fungal isolates with falcate/curved conidia from 11 different plant species were obtained. Fungal isolates showed high diversity in terms of morphological criteria and colony characteristics. Grouping of isolates was based on morphology and comparison of DNA fingerprinting pattern using BOX molecular marker. Identification of isolates was performed by combining morphological criteria and phylogenetic analyses based on the nucleotide sequence of the TUB2 gene. The results showed that the isolates belong to two known species, C. truncatum and C. trichellum, and two unknown species; including Colletotrichum sp. 1 obtained from wild parsley (Anthryscus sylvestris) and Colletotrichum sp. 2 obtained from Dumb canes (Diffenbachia amoena). This study is the first report of C. truncatum from Chinese evergreens (Aglaonema silver queen(, Adenium (Adenium obesum(, Weeping fig (Ficus benjamina(, Arrowhead plant (Syngonium podophyllum) and C. trichellum from paper flower (Bougainvillea glabra) in the world. To our knowledge, wild parsley is a new host for genus Colletotrichum. The Colletotrichum sp. 2 obtained from Dumb canes (Diffenbachia amoena) is considered as a new species candidate for the world's mycobiota. Comprehensive morphological studies and multigene phylogenetic analysis are underway to describe the species.
Keywords
anthracnose, DNA fingerprinting, morphology, sequencing