اولین گزارش از همراهی یک فیتوپلاسما مرتبط با بیماری ریزبرگی پنبه در فساء استان فارس
کد مقاله : 1849-24IPPC (R3)
نویسندگان
1دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی دانشگاه شیراز
2دانشجوی دکترای بیماری شناسی گیاهی، دانشکده‌ی کشاورزی، دانشگاه شیراز
3مرکز تحقیقات ویروس‌شناسی گیاهی، دانشگاه شیراز
4استادیار بیماری شناسی‌گیاهی، دانشگاه پیام نور، تهران.
چکیده
پنبه یکی از محصولات اقتصادی مهم در استان فارس است. در بازدید‌هایی که در سال زراعی 1400- 99 که از مزارع پنبه در این منطقه به‌عمل آمد در برخی از مزارع شهرستان فساء، بیماری ریز برگی و جارویی شدن روی پنبه مشاهده شد. به‌منظور سبب‌شناسی بیماری ریزبرگی پنبه از پنج بوته پنبه دارای علائم بارز بیماری شامل: ریزبرگی، جاروک، پیچیدگی برگ‌های انتهایی و کوتولگی و همچنین سه بوته بدون علائم نمونه‌برداری و، دی.ان.ای کل از برگ نمونه‌های جمع‌آوری شده با روش CTAB استخراج شد. در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) دو مرحله‌ای ابتدا با استفاده ازجفت آغازگر P1/P7 (Smart et al., 1996 ) منطبق‌بر بخشی از ناحیه‌ی DNA 16Sr منجر‌به تکثیر قطعه‌ای به‌اندازه‌ی 1500 جفت‌باز در نمونه‌های آلوده شد. در مرحله دوم (Nested PCR) از جفت‌آغازگر R16F2n/R16R2 (Gundersen & Lee, 1996) استفاده شد و قطعه مورد انتظار با اندازه‌ی تقریبی 1300 جفت‌باز از محصولات PCR نمونه‌های گیاهان آلوده، تکثیر شد. محصول PCR حاصل تعیین ترادف شد و با توالی‌های موجود در بانک ژنی (NCBI) مورد مقایسه قرار گرفت. بلاست توالی نشان‌دهنده شباهت بسیار زیاد فیتوپلاسمای جدا شده از شهر فساء با سایر فیتوپلاسماهای همراه با پنبه که از کشورهای بورکینافاسو (با رس‌شمار JQ868439 و هومولوژی 99.5 درصد)، مالی (با رس‌شمارEF363314 و هومولوژی 99.5 درصد) و هندوستان (از روی گیاهان Corynandra viscosa با رس‌شمارMZ424217) و پاکستان (از روی گیاه Cannabis sativa با رس‌شمارMZ424216 و هومولوژی 98.89 درصد) که همگی از زیرگروه یک هستند. بر اساس اطلاعات نویسندگان این اولین گزارش از همراهی یک فیتوپلاسما از زیر گروه یک با بیماری بوته‌انبوهی و کوتولگی پنبه در ایران است.
کلیدواژه ها
Title
The first report of an association of a phytoplasma with cotton witchs broom disease in fasa, fars province
Authors
Masoud Rezaei, mehrdad salehzadeh, alireza afsharifar, saeideh dehghanpour farashah
Abstract
Cotton (Gossypium spp.) is an economically important crop in south eastern region of fars province. In a survey which carried out during 2021-2022 in cotton fields of fasa region, Phyllody and cotton witches’-broom disease was observed. For the etiology of cotton Phyllody disease, Total DNA was extracted from five symptomatic and two asymptomatic cotton plants using a CTAB-based method. To assess the phytoplasma presence the extracted DNA samples were subjected to a two-step PCR using . phytoplasma universal primer pair P1/P7 (Smart et al., 1996) targeting the 16srDNA gene (which amplify a fragment of about 1500bp), followed by nested PCR using a pair of specific primers R16F2n / R16R2 (Gundersen & Lee, 1996) on P1/P7 amplicon, with resulting amplicon size of approximately 1300 bp. Sequence blasts show high similarity of phytoplasma isolated from Fasa city with other phytoplasmas with cotton from Burkina Faso (JQ868439 and 99.5% homology), Mali (EF363314 and 99.5% homology) And India (from Corynandra viscosa (MZ424217) and Pakistan (from Cannabis sativa (MZ424216) and homology 98.89%). which are all from subgroup one. According to the authors, this is the first report of association of a phytoplasma from subgroup one with shrub disease and cotton dwarfism in Iran.
Keywords
Phytoplasma, cotton, Phyllody, Polymerase chain reaction, Fasa