اولین گزارش از همراهی یک فیتوپلاسمای همراه با ریز برگی پنبه و زردی عروسک پشت‌پرده در استان فارس
کد مقاله : 1850-24IPPC (R2)
نویسندگان
1دانشجوی دکترای بیماری شناسی گیاهی، دانشکده‌ی کشاورزی، دانشگاه شیراز
21- مرکز تحقیقات ویروس‌شناسی گیاهی، دانشگاه شیراز
3مرکز تحقیقات ویروس‌شناسی گیاهی، دانشگاه شیراز
4استادیار بیماری شناسی‌گیاهی، دانشگاه پیام نور، تهران.
چکیده
عروسک پشت‌پرده (Physalis sp.) یکی از علف‌های هرز مهم مزارع پنبه در استان فارس است. این گیاه علاوه‌بر خسارت مستقیم بر روی محصول اصلی، به‌صورت غیرمستقیم به‌عنوان میزبان مخزن مهم برای آفات و بیماری‌های پنبه به‌ویژه ویروس‌ها، باکتری‌ها و ناقلین آنها عمل می‌کند. در این پژوهش به‌منظور بررسی اتیولوژی بیماری پیچیدگی و بوته‌انبوهی ارقام پا‌بلند پنبه در شهرستان فساء (استان فارس)، از علف‌های هرز مختلف موجود در مزارع پنبه از‌جمله علف‌های هرز عروسک پشت‌پرده (Physalis sp.)، سلمه‌تره (Chenopodium sp.)، تاجریزی (Solanum nigrum)، تاج‌خروس (Amaranthus retroflectus)، پنیرک (Malva sp.) و داتوره (Datura stramonium) با علائم زردی، پیچیدگی و کوچکی برگ‌های انتهایی و در برخی موارد بوته‌انبوهی نمونه‌برداری انجام شد. دی. ان. ای کل با استفاده از روش CTAB استخراج و در واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (PCR) به‌کار رفت. تلاش برای ردیابی فیتوپلاسمای مرتبط با کوتولگی و برگ‌انبوهی ارقام پایه‌بلند موجود در علف‌های هرز مزارع پنبه از نمونه‌های دارای علائم با استفاده از یک جفت‌آغازگر دژنره فیتوپلاسماها (Smart et al., 1996) P7 و P1 منطبق‌بر بخشی از ناحیه‌ی s rDNA16 منجربه تکثیر قطعه‌ای به اندازه‌ی 1500 جفت‌باز دز برخی از علف‌های هرز عروسک پشت‌پرده شد. به‌نظر می‌رسد که برای ردیابی دقیق عامل بیماری باید از روش دیگری بنام Nested PCR استفاده نمود. برای این منظور، استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی بنام R16F2n/R16R2 (Gundersen & Lee, 1996)، منجربه تکثیر یک قطعه با اندازه‌ی حدود 1300 جفت‌باز از گیاهان پنبه و عروسک پشت‌پرده با علائم به‌ترتیب ریزبرگی و زردی شد. تعیین ترادف این قطعات ژنومی، نشان‌دهنده شباهت بسیار زیاد فیتوپلاسمای جدا شده از شهر فساء با سایر فیتوپلاسماهای همراه با پنبه که از کشورهای بورکینافاسو (با رس‌شمار JQ868439 و هومولوژی 99.5 درصد)، مالی (با رس‌شمارEF363314 و هومولوژی 99.5 درصد) و هندوستان (از روی گیاهان Corynandra viscosa با رس‌شمارMZ424217) و پاکستان (از روی گیاه Cannabis sativa با رس‌شمارMZ424216 و هومولوژی 98.89 درصد) که همگی از زیرگروه یک هستند. بلاست توالی‌های تکثیرشده از روی عروسک پشت‌پرده هومولوژی بسیار نزدیکی (99.7 درصد) را با فیتوپلاسمای جدایه‌ی ایرانی گوجه‌فرنگی (با رس‌شمار MN565886) گزارش شده است، نشان داد. نتایج حاصل از این پژوهش نشان می‌دهد فیتوپلاسمایی که عروسک‌پشت پرده را در مزارع پنبه شهرستان فساء استان فارس آلوده می‌کند مستقل از فیتوپلاسمائی است که از روی پنبه و گیاهان خانواده‌ی Malvaceae از کشورهای دیگر گزارش شده است و احتمالا این نوع فیتوپلاسما از مزارع گوجه‌فرنگی که در مجاورت پنبه کاشته می‌شوند یا در اثر کشت متناوب پنبه و گوجه‌فرنگی روی گیاه عروسک پشت‌پرده منتقل شده است و به‌عنوان مخزن برای این نوع فیتوپلاسما عمل می‌کند.
کلیدواژه ها
Title
First report of association of a phytoplasma with cotton witchs broom and Physalis sp. yellows in Fars province
Authors
mehrdad salehzadeh, masoud rezaei, alireza afsharifar, saeideh dehghanpour farashah
Abstract
Physalis sp. Is one of the most important weeds in cotton fields in Fars Province. In addition to direct damage to the main crop, this plant also indirectly acts as an important reservoir for cotton pests and diseases, especially viruses, bacteria and their carriers. In this study, in order to investigate the etiology of the disease complexity and plant abundance of tall cotton cultivars in Fasa city (Fars province), from various weeds in cotton fields, including Physalis sp., Chenopodium sp., Solanum nigrum, Amaranthus retroflectus, Malva sp. and Datura stramonium with signs of yellowing, complexity and small end leaves In some cases, massive plants were sampled. January The whole was extracted using CTAB method and used in polymerase chain reaction (PCR). Attempts to Detect Phytoplasma Associated with Dwarfism and Leaf Crowds of Highly Plant Cultivars in Cotton Field Weeds from Symptomatic Specimens Using a Degenerative Primer Pair of Phytoplasma (Smart et al., 1996) P7 and P1 Part of the 16s rDNA region was amplified by a 1500 bp fragment of some of the puppet weeds behind the curtain. It seems that another method called Nested PCR should be used to accurately track the cause of the disease. For this purpose, the use of a pair of proprietary primers called R16F2n / R16R2 (Gundersen & Lee, 1996), led to the propagation of a piece with a size of about 1300 bp of cotton and Physalis sp. plants. Sequence blasts show high similarity of phytoplasma isolated from Fasa city with other phytoplasmas with cotton from Burkina Faso (JQ868439 and 99.5% homology), Mali (EF363314 and 99.5% homology) And India (from Corynandra viscosa (MZ424217) and Pakistan (from Cannabis sativa (MZ424216) and homology 98.89%). which are all from subgroup one.Sequencing of this genome fragment showed a very close homology (99.7%) to the phytoplasma of Iranian tomato isolate (MN565886). The results of this study show that the phytoplasma that infects the Physalis sp behind the curtain in the cotton fields of Fasa city of Fars province is independent of the phytoplasma that has been reported from the cotton and plants of the Malvaceae family from other countries. Phytoplasma type is transferred from tomato fields that are planted near cotton or due to intermittent cultivation of cotton and tomato on the physalis sp plant behind the curtain and acts as a reservoir for this type of phytoplasma.
Keywords
Phytoplasma, Gossypium sp, Physalis sp, Phyllody, nested PCR, Fasa