اولین گزارش از همراهی یک فیتوپلاسما از گروه 16SrII با بیماری فیلودی عروسک پشت پرده

کد مقاله : 1871-24IPPC (R3)
نویسندگان
1بخش گیاه پزشکی، دانشگاه شیراز
2گیاه پزشکی و مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی
3کارشناس حفظ نباتات
4مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، بخش گیاه پزشکی، دانشگاه شیراز
چکیده
عروسک پشت پرده (Physalis angulata) یکی از علف‌های هرز مهم در مزارع سبزی صیفی و گیاهان روغنی در ایران و بسیاری از نقاط دنیا است. در آبان سال 1400 در بازدیدهای انجام گرفته از مزارع کنجد شهرستان حاجی آباد استان هرمزگان، علائم آلودگی فیتوپلاسمایی شامل فیلودی، جارویی و ریز برگی در تعدادی از گیاهان کنجد و علف هرز عروسک پشت پرده داخل و حاشیه مزرعه مشاهده شد. برای شناسایی فیتوپلاسمای همراه با بیماری فیلودی عروسک پشت پرده، استخراج دی‌اِن‌اَی از 2/0 گرم بافت رگبرگ گیاهان دارا و فاقد علایم با روش CTAB انجام شد. ردیابی فیتوپلاسما در نمونه‌های دی‌اِن‌اَی با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) مستقیم با استفاده از جفت آغازگر عمومی Rl6mF2/R16mR1 مبتنی بر آر‌اِن‌اَی ریبوزمی (16S rRNA) انجام شد. در تمام نمونه‌های دارای علائم در آزمون‌ PCR مستقیم قطعه مورد انتظار 1434 جفت بازی تکثیر شد. تحت همین شرایط در نمونه‌های فاقد علائم و آب مقطر سترون چنین قطعه‌ای تکثیر نشد. به منظور تایید شناسایی، محصول PCR به‌طور مستقیم تعیین توالی و با نرم‌افزارهای مربوطه ویرایش شد. نتایج جستجوی بلاست با استفاده از توالی به دست آمده (رس شمار: OM963128) نشان داد که فیتوپلاسمای همراه با بیماری فیلودی عروسک پشت پرده بیشترین شباهت را با فیتوپلاسماهایی از گروه 16SrII (رس شمارهای: MK421430، MK217101 و MF071490) ، Candidatus Phytoplasma aurantifolia، دارد. مقایسه چند شکلی طولی قطعات برشی (RFLP) مجازی با نرم افزار iPhyClassifier نیز تعلق فیتوپلاسمای همراه بیماری فیلودی عروسک پشت پرده (Cutleaf groundcherry phyllody phytoplasma, (CgPP)) را به زیرگروه 16SrII-D تایید کرد. در گذشته فیتوپلاسمای همراه با فیلودی عروسک پشت پرده از چین گزارش شده است، که از نظر رده‌بندی در گروه زردی مینا (16SrI-D) قرار دارد. این اولین گزارش از آلودگی طبیعی علف هرز عروسک پشت پرده به Ca. Phytoplasma aurantifolia در ایران و جهان است.
کلیدواژه ها
 
Title
First report of a 16SrII group phytoplasma associated with cutleaf groundcherry phyllody
Authors
Mohsen Amiri Mazraie, Keramtilah Izadpanah, Mohsen Taghavi, Siavash Samavi, Keramatullah Izadpanah
Abstract
Cutleaf groundcherry (Physalis angulata) is one of the most important weeds in vegetable and oilseed fields in Iran and many parts of the world. In October 2021, several cutleaf groundcherry plants with typical symptoms of phytoplasms diseases were observed in the sesame fields of Haji Abad (Hormozgan province, Iran). The symptomatic plants showed phyllody, witches broom and little leaf. To identify association of phytoplasma with the symptomatic plants, the total genomic DNA were extracted from 0.2 g midribs using modified cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) method. The samples were analyzed for phytoplasma DNA by direct-PCR using the phytoplasma universal primer pair Rl6mF2/R16mR1. fragments of expected size (1434 bp) were amplified with direct PCR in sample of symptomatic plants but not in sample of symptomless plant or sterile distilled water as negative controls. A positive PCR product was directly sequenced and deposited in GenBank under accession no. OM963128. A BLAST search using sequenced fragment showed that the phytoplasma associated with cutleaf groundcherry phyllody (CgP) had 100 % nucleotide identity with those of phytoplasma members (MK421430, MK217101 and MF071490) of the 16SrII group, Candidatus Phytoplasma aurantifolia. Virtual restriction fragment length polymorphism with iPhyClassifier software revealed that CgP phytoplasma belonged to 16SrII-D subgroup. Phytoplasma disease has been reported with cutleaf groundcherry from China, which is closer to the members of the aster yellows group (16SrI-D). To our knowledge, this is the first report of natural infection of cutleaf groundcherry by a 16SrII group phytoplasma in Iran and most probably in the world.
Keywords
Detection, CgPP, 16SrII-D