اولین گزارش از ویروس چروکیدگی قهوه ای میوه گوجه فرنگی در گلخانه‌های گوجه فرنگی استان هرمزگان

کد مقاله : 1899-24IPPC (R2)
نویسندگان
1کارشناس حفظ نباتات
2بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
3بخش حفظ نباتات سازمان جهاد کشاورزی استان هرمزگان
4بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آمـوزش کـشاورزی و منـابع طبیعـی هرمزگـان، سـازمان تحقیقـات، آمـوزش و تـرویج کشاورزی، بندرعباس، ایران
5ریاست بخش تحقیقات گیاه پزشکی
6اداره حفظ نباتات، سازمان جهاد کشاورزی استان هرمزگان
چکیده
در آذر سال 1400، بیماری ویروسی چروکیدگی قهوه‌ای میوه گوجه فرنگی، Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV)، در گلخانه-های گوجه فرنگی و فلفل مناطق مختلف استان هرمزگان شامل شهرستان‌های میناب، رودان و حاجی آباد پایش شد. پیرو این بررسی‌ها، علایم مشکوک آلودگی به ویروس ToBRFV شامل چروکیدگی، قهوه‌ای و بد شکل شدن میوه، ایجاد تاول روی برگ‌ها، لکه‌های موازئیک شکل روی برگ، نکروز و پژمردگی گل و دُم میوه (کاسبرگ) و رنگ پریدگی و زردی عمومی در سطح حدود 28 هکتار از گلخانه‌های گوجه فرنگی شهرستان حاجی‌آباد در رقم هیبرید F1 دافنیس (سینجنتا، سوئیس) مشاهده شد. برای شناسایی عامل بیماری از گلخانه‌های یاد شده، نمونه‌هایی از بوته-های دارای علایم ظاهری مشکوک به بیماری ToBRFV، جمع آوری و پس از انتقال به آزمایشگاه، استخراج آر‌اِن‌اِی از آن‌ها با استفاده از محلول RNX Plus (سیناکلون، ایران) انجام شد. ردیابی ToBRFV در نمونه‌ها به روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ToBRFV-F (5'-GAAGTCCCGATGTCTGTAAGG-3') وToBRFV-R ‌‌‌ (5'-GTGCCTACGGATGTGTATGA-3') انجام شد. در نمونه‌های دارای علایم در آزمون RT-PCR، قطعه مورد انتظار 842 جفت بازی تکثیر شد. تحت همین شرایط در نمونه‌های فاقد علایم و آب مقطر سترون چنین قطعه‌ای تکثیر نشد. به منظور تأیید شناسایی، محصول PCR چهار نمونه دارای علایم ویروسی، به‌طور مستقیم تعیین توالی و با نرم‌افزارهای مربوطه ویرایش شد. نتایج جستجوی بلاست با استفاده از توالی‌های به دست آمده (رس‌شمارهای ON191569، ON191570، ON191571 و ON191572) ماهیت ویروسی بیماری را تأیید کرد و نشان داد که ویروس ToBRFV جدا شده از گلخانه-های گوجه فرنگی استان هرمزگان، %63/99 شباهت با جدایه Iran-1 ثبت شده از اصفهان و %38/99 با جدایه Tom1-Jo از اردن به ترتیب با رس شمارهای OK075081 و KT383474 دارد. این اولین گزارش آلودگی گوجه‌فرنگی به ToBRFV از استان هرمزگان است.
کلیدواژه ها
 
Title
First report of Tomato brown rugose fruit virus in greenhouse tomato in Hormozgan province
Authors
Siavash Samavi, Mohsen Amiri Mazraei, Abdolreza Ashrafmansouri, Abdoolnabi Bagheri, Majeed Askari Seyahooei, Fariborz Shohraty, Akhtar Mohammadi Rad
Abstract
In December 2021, Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) was inspected in tomato and pepper greenhouses in Hormozgan province, including Minab, Roudan and HajiAbad. Symptoms of a viral-like infection were observed on cv. Dafnis F1 (Syngenta, Switzerland) in 28 ha tomato greenhouses in HajiAbad city. The symptoms consisted of deformation of leaves, severe mosaic and chlorotic and brown necrotic spots on the fruits. Samples with viral-like symptoms were collected. RNA was extracted using RNX Plus solution (Sinaclon, Iran). The samples were also subjected to RT-PCR using ToBRFV-specific primers: ToBRFV-F (5'-GAAGTCCCGATGTCTGTAAGG-3') and ToBRFV-R (5'- GTGCCTACGGATGTGTATGA-3'). The expected fragment obtained from the PCR reaction (842 bp) was amplified and isolated in the symptomatics samples. The PCR product of four samples directly Sanger sequenced (Codon Genetic Group, Iran) and deposited in the GenBank database under the following accession numbers: ON191569, ON191570, ON191571 and ON191572. Sequence comparison using BLAST verified the presence of ToBRFV in the samples. The sequence was 99.63% identical with that of ToBRFV isolate Iran-1 (OK075081) from Iran, Isfahan province and 99.38% to isolate Tom1-Jo (KT383474) from Jordan. To our knowledge, this is the first report of infection of tomato by ToBRFV in Hormozgan province of Iran.
Keywords
Detection, Rugose, ToBRFV