گزارش جدیدی از گونه‌های جنس Alternaria متعلق به بخش Nimbya در ایران
کد مقاله : 1142-24IPPC (R3)
نویسندگان
1مرکز آموزش عالی شهید باکری میاندوآب، دانشگاه ارومیه
2گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه
3گروه گیاهپزشکی/ دانشکده کشاورزی/ دانشگاه ارومیه
4مرکز آموزش عالی شهید باکری میاندوآب
چکیده
در راستای شناسایی گونه‌های متعلق به بخش Nimbya از جنس Alternaria، نمونه‌های آلوده‌ی برگ از گیاهان خانواده‌های Cyperaceae و Juncaceae طی سال‌های 1398-1396 از مناطق مختلف استان آذربایجان‌غربی جمع‌آوری گردید. نمونه‌ها ابتدا با آب مقطر سترون شسته شدند، سپس با محلول هیپوکلریت سدیم 5/0 درصد به مدت یک دقیقه ضد عفونی سطحی گردیدند و مجدداً سه بار با آب مقطر سترون آبکشی شدند. پس از رطوبت‌گیری نمونه‌ها، قطعات کوچکی (به طول تقریبی یک سانتی‌متر) از حدفاصل قسمت‌های آلوده و سالم بریده شدند و به تشتک‌های پتری حاوی محیط‌های کشت سیب زمینی-دکستروز-آگار (PDA)، آب-آگار دو درصد (WA 2%) و APDA (محیط غذایی PDA حاوی 5/2 میلی‌لیتر در لیتر اسید لاکتیک 25 درصد) منتقل گردیدند. تشتک‌های پتری در انکوباتور با دمای 223 درجه سلسیوس نگهداری شدند. همچنین، از روش کاغذ صافی مرطوب نیز برای جداسازی قارچ‌ها استفاده شد و قارچ‌های رشد کرده در سطح نمونه‌های گیاهی، مستقیماً با سوزن ظریف سترون برداشته و به تشتک‌های حاوی محیط کشت PDA منتقل شدند. جدایه‌های به دست آمده به روش تک هاگ خالص‌سازی شدند. شناسایی ریخت‌شناختی جدایه‌های خالص‌شده با کشت آنها روی محیط کشت سیب زمینی-هویج-آگار (PCA) و نگهداری در شرایط استاندارد (16 ساعت تاریکی و هشت ساعت روشنایی تحت نور سفید فلورسنت، دمای 223 درجه سلسیوس) انجام گرفت. تعداد 30 جدایه با ویژگی‌های معمول بخش Nimbya از جنس Alternaria و از گونه‌های مختلف گیاهان خانواده‌های Cyperaceae و Juncaceae جداسازی گردید. جهت تایید شناسایی اولیه جدایه‌ها، ناحیه ITS-rDNA و بخشی از ژن‌های gapdh، rpb2، tef-1a و alt a 1 جدایه‌ها به ترتیب با آغازگرهای ITS1/ITS4، gpd1/gpd2، RPB2–5F2/RPB2–7cR، EF1-728F/EF1-986R و Alt-for/Alt-rev تکثیر و توالی‌یابی شد. بر اساس ترکیب داده‌های ریخت‌شناختی و واکاوی تبارشناختی مبتنی بر پنج ژن، پنج گونه شامل Alternaria caricicola، A. scirpivora، Alternaria sp. 1، Alternaria sp. 2 و Alternaria sp. 3 شناسایی گردید. گونه A. scripivora برای بیوتای قارچی ایران جدید می‌باشد و سه گونه‌ی Alternaria sp. 1، Alternaria sp. 2 و Alternaria sp. 3 آرایه‌های جدید برای بیوتای قارچی دنیا می‌باشند.
کلیدواژه ها